在股权转让过程中是会涉及到所得税的，很多人在交易当中往往不够明确，导致相关纠纷的产生，那么你知道公司股权转让所得税管理办法是什么吗？法律快车小编为大家整理了相关的法律知识，下面一起来看看吧，相信会对你有所帮助。

　　一、公司股权转让所得税管理办法

　　第一章 总 则

　　第一条 为加强股权转让所得个人所得税征收管理，规范税务机关、纳税人和扣缴义务人征纳行为，维护纳税人合法权益，根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例、《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则，制定本办法。

　　第二条 本办法所称股权是指自然人股东（以下简称个人）投资于在中国境内成立的企业或组织（以下统称被投资企业，不包括个人独资企业和合伙企业）的股权或股份。

　　第三条 本办法所称股权转让是指个人将股权转让给其他个人或法人的行为，包括以下情形：

　　（一）出售股权;

　　（二）公司回购股权;

　　（三）发行人首次公开发行新股时，被投资企业股东将其持有的股份以公开发行方式一并向投资者发售;

　　（四）股权被司法或行政机关强制过户;

　　（五）以股权对外投资或进行其他非货币性交易;

　　（六）以股权抵偿债务;

　　（七）其他股权转移行为。

　　第四条 个人转让股权，以股权转让收入减除股权原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按“财产转让所得”缴纳个人所得税。

　　合理费用是指股权转让时按照规定支付的有关税费。

　　第五条 个人股权转让所得个人所得税，以股权转让方为纳税人，以受让方为扣缴义务人。

　　第六条 扣缴义务人应于股权转让相关协议签订后5个工作日内，将股权转让的有关情况报告主管税务机关。

　　被投资企业应当详细记录股东持有本企业股权的相关成本，如实向税务机关提供与股权转让有关的信息，协助税务机关依法执行公务。

　　第二章 股权转让收入的确认

　　第七条 股权转让收入是指转让方因股权转让而获得的现金、实物、有价证券和其他形式的经济利益。

　　第八条 转让方取得与股权转让相关的各种款项，包括违约金、补偿金以及其他名目的款项、资产、权益等，均应当并入股权转让收入。

　　第九条 纳税人按照合同约定，在满足约定条件后取得的后续收入，应当作为股权转让收入。

　　第十条 股权转让收入应当按照公平交易原则确定。

　　第十一条 符合下列情形之一的，主管税务机关可以核定股权转让收入:

　　（一）申报的股权转让收入明显偏低且无正当理由的;

　　（二）未按照规定期限办理纳税申报，经税务机关责令限期申报，逾期仍不申报的;

　　（三）转让方无法提供或拒不提供股权转让收入的有关资料;

　　（四）其他应核定股权转让收入的情形。

　　第十二条 符合下列情形之一，视为股权转让收入明显偏低:

　　（一）申报的股权转让收入低于股权对应的净资产份额的。其中，被投资企业拥有土地使用权、房屋、房地产企业未销售房产、知识产权、探矿权、采矿权、股权等资产的，申报的股权转让收入低于股权对应的净资产公允价值份额的;

　　（二）申报的股权转让收入低于初始投资成本或低于取得该股权所支付的价款及相关税费的;

　　（三）申报的股权转让收入低于相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权转让收入的;

　　（四）申报的股权转让收入低于相同或类似条件下同类行业的企业股权转让收入的;

　　（五）不具合理性的无偿让渡股权或股份;

　　（六）主管税务机关认定的其他情形。

　　第十三条 符合下列条件之一的股权转让收入明显偏低，视为有正当理由：

　　（一）能出具有效文件，证明被投资企业因国家政策调整，生产经营受到重大影响，导致低价转让股权;

　　（二）继承或将股权转让给其能提供具有法律效力身份关系证明的配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹以及对转让人承担直接抚养或者赡养义务的抚养人或者赡养人;

　　（三）相关法律、政府文件或企业章程规定，并有相关资料充分证明转让价格合理且真实的本企业员工持有的不能对外转让股权的内部转让;

　　（四）股权转让双方能够提供有效证据证明其合理性的其他合理情形。

　　第十四条 主管税务机关应依次按照下列方法核定股权转让收入:

　　（一）净资产核定法

　　股权转让收入按照每股净资产或股权对应的净资产份额核定。

　　被投资企业的土地使用权、房屋、房地产企业未销售房产、知识产权、探矿权、采矿权、股权等资产占企业总资产比例超过20%的，主管税务机关可参照纳税人提供的具有法定资质的中介机构出具的资产评估报告核定股权转让收入。

　　6个月内再次发生股权转让且被投资企业净资产未发生重大变化的，主管税务机关可参照上一次股权转让时被投资企业的资产评估报告核定此次股权转让收入。

　　（二）类比法

　　1.参照相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权转让收入核定;

　　2.参照相同或类似条件下同类行业企业股权转让收入核定。

　　（三）其他合理方法

　　主管税务机关采用以上方法核定股权转让收入存在困难的，可以采取其他合理方法核定。

　　第三章 股权原值的确认

　　第十五条　个人转让股权的原值依照以下方法确认：

　　（一）以现金出资方式取得的股权，按照实际支付的价款与取得股权直接相关的合理税费之和确认股权原值;

　　（二）以非货币性资产出资方式取得的股权，按照税务机关认可或核定的投资入股时非货币性资产价格与取得股权直接相关的合理税费之和确认股权原值;

　　（三）通过无偿让渡方式取得股权，具备本办法第十三条第二项所列情形的，按取得股权发生的合理税费与原持有人的股权原值之和确认股权原值;

　　（四）被投资企业以资本公积、盈余公积、未分配利润转增股本，个人股东已依法缴纳个人所得税的，以转增额和相关税费之和确认其新转增股本的股权原值;

　　（五）除以上情形外，由主管税务机关按照避免重复征收个人所得税的原则合理确认股权原值。

　　第十六条 股权转让人已被主管税务机关核定股权转让收入并依法征收个人所得税的，该股权受让人的股权原值以取得股权时发生的合理税费与股权转让人被主管税务机关核定的股权转让收入之和确认。

　　第十七条 个人转让股权未提供完整、准确的股权原值凭证，不能正确计算股权原值的，由主管税务机关核定其股权原值。

　　第十八条 对个人多次取得同一被投资企业股权的，转让部分股权时，采用“加权平均法”确定其股权原值。

　　第四章 纳税申报

　　第十九条 个人股权转让所得个人所得税以被投资企业所在地地税机关为主管税务机关。

　　第二十条 具有下列情形之一的，扣缴义务人、纳税人应当依法在次月15日内向主管税务机关申报纳税：

　　（一）受让方已支付或部分支付股权转让价款的;

　　（二）股权转让协议已签订生效的;

　　（三）受让方已经实际履行股东职责或者享受股东权益的;

　　（四）国家有关部门判决、登记或公告生效的;

　　（五）本办法第三条第四至第七项行为已完成的;

　　（六）税务机关认定的其他有证据表明股权已发生转移的情形。

　　第二十一条 纳税人、扣缴义务人向主管税务机关办理股权转让纳税（扣缴）申报时，还应当报送以下资料：

　　（一）股权转让合同（协议）;

　　（二）股权转让双方身份证明;

　　（三）按规定需要进行资产评估的，需提供具有法定资质的中介机构出具的净资产或土地房产等资产价值评估报告;

　　（四）计税依据明显偏低但有正当理由的证明材料;

　　（五）主管税务机关要求报送的其他材料。

　　第二十二条 被投资企业应当在董事会或股东会结束后5个工作日内，向主管税务机关报送与股权变动事项相关的董事会或股东会决议、会议纪要等资料。

　　被投资企业发生个人股东变动或者个人股东所持股权变动的，应当在次月15日内向主管税务机关报送含有股东变动信息的《个人所得税基础信息表（A表）》及股东变更情况说明。

　　主管税务机关应当及时向被投资企业核实其股权变动情况，并确认相关转让所得，及时督促扣缴义务人和纳税人履行法定义务。

　　第二十三条 转让的股权以人民币以外的货币结算的，按照结算当日人民币汇率中间价，折算成人民币计算应纳税所得额。

　　第五章 征收管理

　　第二十四条 税务机关应加强与工商部门合作，落实和完善股权信息交换制度，积极开展股权转让信息共享工作。

　　第二十五条 税务机关应当建立股权转让个人所得税电子台账，将个人股东的相关信息录入征管信息系统，强化对每次股权转让间股权转让收入和股权原值的逻辑审核，对股权转让实施链条式动态管理。

　　第二十六条 税务机关应当落实好国税部门、地税部门之间的信息交换与共享制度，不断提升股权登记信息应用能力。

　　第二十七条 税务机关应当加强对股权转让所得个人所得税的日常管理和税务检查，积极推进股权转让各税种协同管理。

　　第二十八条 纳税人、扣缴义务人及被投资企业未按照规定期限办理纳税（扣缴）申报和报送相关资料的，依照《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则有关规定处理。

　　第二十九条 各地可通过政府购买服务的方式，引入中介机构参与股权转让过程中相关资产的评估工作。

　　第六章 附 则

　　第三十条 个人在上海证券交易所、深圳证券交易所转让从上市公司公开发行和转让市场取得的上市公司股票，转让限售股，以及其他有特别规定的股权转让，不适用本办法。

　　第三十一条 各省、自治区、直辖市和计划单列市地方税务局可以根据本办法，结合本地实际，制定具体实施办法。

　　二、股权转让合同书

　　出让方：＿＿＿＿＿　（以下简称甲方）　住　址：　法定代表人：

　　受让方：＿＿＿＿＿　（以下简称乙方）　住　址：　法定代表人：

　　甲、乙双方根据有关法律、法规的规定，经友好协商，就甲方将其所持＊＊＊＊＊公司（下称“目标公司”）＊％的股权转让给乙方之相关事宜，达成一致，特签订本合同，以使各方遵照执行。

　　一、转让标的

　　甲方向乙方转让的标的为：甲方合法持有目标公司＊％的股权。

　　二、各方的陈述与保证

　　1、甲方的陈述与保证：

　　（1）甲方为依法成立并合法存续的公司法人，具有独立民事行为能力；

　　（2）甲方为目标公司的股东，合法持有该公司＊％的股权；

　　（3）甲方承诺本次向乙方转让其所持有的目标公司的股权未向任何第三人设臵担保、质押或其他任何第三者权益，亦未受到来自司法部门的任何限制；

　　（4）甲方承诺其本次向乙方转让股权事宜已得到其有权决策机构的批准；

　　（5）甲方承诺积极协助乙方办理有关的股权转让过户手续；在有关手续办理完毕之前，甲方不得处臵目标公司的任何资产，并不得以目标公司的名义为他人提供担保、抵押；

　　（6）甲方确认在本合同签订前，目标公司及其自身向乙方作出的有关目标公司的法人资格、合法经营及合法存续状况、资产权属及债权债务状况、税收、诉讼与仲裁情况，以及其他纠纷或可能对公司造成不利影响的事件或因素均真实、准确、完整，不存在任何的虚假、不实、隐瞒，并愿意承担目标公司及其自身披露不当所引致的任何法律责任。

　　2、乙方的陈述与保证：

　　（1）乙方为依法成立并合法存续的公司法人，具有独立民事行为能力；

　　（2）乙方对本次受让甲方转让目标公司＊％股权的行为已得到了有权机构的批准，并对目标公司的基本状况有所了解；

　　（3）乙方保证其具有支付本次股权转让价款的能力；

　　（4）乙方保证在其成为目标公司的股东后将进一步促进和支持该公司的发展。

　　三、转让价款及支付

　　1、甲、乙双方同意并确认，本合同项下的股权转让价款为￥××万元人民币（大写：人民币××××元）。

　　2、甲、乙双方同意，待目标公司＊％股权过户至乙方名下后　日内，由乙方将股权转让款一次性支付给甲方，甲方应在收款之同时，向乙方开具合规的收据。

　　四、合同生效条件

　　当下述的两项条件全部成就时，本合同始能生效。该条件为：

　　1、本合同已由甲、乙双方正式签署；

　　2、本合同已得到了各方权力机构（董事会或股东会）的授权与批准。

　　五、股权转让完成的条件

　　1、甲、乙双方完成本合同所规定的与股权转让有关的全部手续，并将所转让的目标公司　＊％　的股权过户至乙方名下。

　　2、目标公司的股东名册、公司章程及工商管理登记档案中均已明确载明乙方持有该股权数额。

　　六、违约责任

　　1、甲、乙双方均需全面履行本合同约定的内容，任何一方不履行本合同的约定或其附属、补充条款的约定均视为该方对另一方的违约，另一方有权要求该方支付违约金并赔偿相应损失。

　　2、本合同的违约金为本次股权转让总价款的5％，损失仅指一方的直接的、实际的损失，不包括其他。

　　3、遵守合同的一方在追究违约一方违约责任的前提下，仍可要求继续履行本合同或终止合同的履行。

　　七、合同的变更与终止

　　1、本合同双方当事人协商一致并签订书面补充协议方可对本合同进行变更或补充。

　　2、双方同意，出现以下任何情况本合同即告终止：

　　（1）甲、乙双方依本合同所应履行的义务已全部履行完毕，且依本合同所享有的权利已完全实现。

　　（2）经甲、乙双方协商同意解除本合同。

　　（3）本合同所约定的股权转让事宜因其他原因未取得相关主管机关批准。

　　本合同因上述第（2）、（3）项原因而终止时，甲方应在10日内全额返还乙方已经支付的股权转让价款。

　　3、本合同的权利义务终止后，当事人应遵循诚实、信用原则，根据交易习惯履行通知、协助、保密等义务。

　　八、保密

　　任何一方对其在本合同磋商、签订、履行过程中知悉的对方的生产经营、投资及其他任何方面的商业秘密，不得向公众或任何第三人泄露、公开或传播此等商业秘密；也不得以自己或其他任何人的利益为目的利用此等商业秘密；除非是：（1）法律要求；（2）社会公众利益要求；（3）对方事先以书面形式同意。

　　九、附则

　　1、因履行本合同产生的任何争议，双方应尽力通过友好协商的方式解决；如协商解决不成，任何一方可向合同签订地有管辖权的人民法院提起诉讼。

　　2、本合同未尽事宜，由双方本着友好协商的原则予以解决，可另行签署补充合同，补充合同与本合同具有同等的法律效力。

　　3、本合同一式四份，甲、乙双方各执壹份，目标公司存档壹份，其余一份报公司登记机关备案。

　　出让方（甲方）：　（盖章）

　　法定代表人（或授权代表）签字：

　　受让方（乙方）：（盖章）

　　法定代表人（或授权代表）签字：

　　签署时间：＿＿＿＿＿年　月　日

　　签署地点：

　　三、公司股权转让怎么办理

　　根据我国公司法律、法规的规定，有限责任公司的股权转让一般要经过如下程序：

　　1、公司受让股权召开公司股东会，研究收购股权的可行性，分析收购股权的目的是否符合公司的战略发展，并对收购方的经济实力经营能力进行分析，严格按照公司法的规定程序进行操作。

　　2、聘请律师进行律师尽职调查。

　　3、出让和受让双方进行实质性的协商和谈判。

　　4、评估、验资（私营有限公司也可以协商确定股权转让价格）。

　　5、股权转让的公司召开股东会，并形成股东会决议，免去转让方股东的相关职务，表决比例和表决方式按照原来公司章程的规定进行，参加会议的股东在《股东会决议》上签字盖章。

　　6、向股东以外的第三人转让股权的，由转让股权的股东向公司董事会提出申请，由董事会提交股东会讨论表决;股东之间转让股权的，不需经过股东会表决同意，只要通知公司及其他股东即可。股东对股权转让给第三方放弃优先购买权，出具放弃优先购买权的承诺或证明。

　　7、双方签订股权转让协议，对转让股权的数额、价格、程序、双方的权利和义务做出具体规定，使其作为有效的法律文书来约束和规范双方的行为。

　　8、需要召开新股东会议，经过新股东会表决同意，任命新股东的相关职务，表决比例和表决方式按照公司章程的规定进行，参加会议的股东在《股东会决议》上签字盖章。讨论新的公司《章程》，通过后在新的公司《章程》上签字盖章。

　　9、收回原股东的出资证明，发给新股东出资证明，对公司股东名册进行变更登记，注销原股东名册，将新股东的姓名或名称，住所地及受让的出资额记载于股东名册，并相应修改公司章程。但出资证明书作为公司对股东履行出资义务和享有股权的证明，只是股东对抗公司的证明，并不足以产生对外公示的效力。

　　10、将新修改的公司章程，股东及其出资变更等向工商行政管理部门进行工商变更登记。《公司登记管理条例》规定，有限责任公司股东转让股权的，应当自转让股权之日起30日内申请变更登记，并应当提交新股东的主体资格证明或者自然人身份证明。

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