股东在加入公司时，公司和股东之间会签订股权协议，股权协议上面有一项重要的条款，就是对股东股权大小和股权比例进行确认。但是股权会随着公司经营而发生变化，如果股东对股权有异议怎么处理？下面法律快车小编为大家介绍下公司股权确认纠纷如何处理的相关内容。

　　一、公司股权确认纠纷如何处理

　　1、自然人、法人或者其他组织向人民法院主张确认其享有公司股权的，须证明以下事实：

　　（一）以货币、实物、知识产权、非专利技术、股权、债券、土地使用权等向公司出资；继受公司股权或者以合法方式取得技术股、赠与股等。

　　（二）已为公司章程或者公司股东名册记载为公司股东。

　　2、有限责任公司出资人履行出资义务或者股权受让人受让股权之后，公司未向其签发出资证明书或者未将其记载于公司股东名册的，股东可以向人民法院提起诉讼，请求公司履行签发记载义务。

　　3、股份有限公司公司成立后，履行出资义务的股东，有权请求公司交付股票；公司不予交付的，股东可以向人民法院提起诉讼，请求公司履行交付义务。

　　通过证券交易市场购买上市股份有限公司股份而成为股东者，其股东身份可以股票交易记录予以证明，其起诉请求公司交付股票的，人民法院不予支持。

　　4、记载于有限责任公司股东名册的公司股东向公司主张股东权利，公司无相反证据证明其请求无理的，人民法院应予支持。

　　有限责任公司未置备股东名册，或者因股东名册登记管理不规范，未及时将出资人或者受让人记载于股东名册，但以其他形式认可出资人或者受让人股东身份的，出资人或者受让人可以依照前款向公司主张权利。

　　5、有限责任公司应当根据公司登记条例将出资人或者股权受让人作为公司股东向公司登记机关申请登记或者变更登记。公司不予申请登记的，出资人或者受让人可以向人民法院提起诉讼，主张其享有公司股权并请求公司履行登记义务。

　　股东向公司主张权利，公司仅以其未在公司登记机关办理股东登记抗辩的，人民法院对其抗辩不予支持。

　　6、有限责任公司出资人履行出资义务或者股权转让的受让人支付受让资金后，公司未向其签发出资证明书、未将其记载于公司股东名册或者未将其作为公司股东向公司登记机关申请登记的，出资人或者受让人提起诉讼，请求判令公司履行签发、记载或申请登记义务的，人民法院应予支持。

　　7、双方约定一方实际出资，另一方以股东名义参加公司，且约定实际出资人为股东或者承担投资风险的，如实际出资人主张名义出资人转交股份财产利益，人民法院应予支持；但违背法律强制性规定的除外。

　　一方实际出资，另一方以股东名义参加公司，但双方未约定实际出资人为股东或者承担投资风险，且实际出资人亦未以股东身份参与公司管理或者实际享受股东权利的，双方之间不应认定为隐名投资关系，可按债权债务关系处理。

　　在上述实际出资人与名义股东之间发生的纠纷中，可以列公司为第三人参加诉讼。

　　8、债权人向工商登记文件中的公司名义股东主张其承担出资不实的赔偿责任的，人民法院应予支持。名义股东向公司债权人承担责任后，可按照约定向实际出资人追偿因此遭受的损失。

　　在上诉纠纷中，公司债权人将实际出资人与名义股东列为共同被告的，人民法院可以根据案情判决双方承担连带责任。名义股东有充分证据证明自己系被他人冒名为股东的，不予承担责任。

　　二、股权纠纷中如何确认股东资格

　　1、股东资格认定具有重要意义

　　由于窝里斗陋习以及“共苦容易同甘难”的社会现象的存在，我国近年来争股夺权的现象较为普遍，在盈利能力较强的公司尤其是有限责任公司尤甚。股东身份长期真假不分、扑朔迷离，必然阻碍公司正常经营，增加股东行权成本，挫伤投资热情。因此，如何认定股东资格，具有非常重要的意义。

　　目前，主张股东资格的证据五花八门，既有实际出资证明，也有股权转让合同、公司章程、股东名册、出资证明书和工商登记等。

　　裁判机构面对林林总总的证据不能眉毛胡子一把抓，而应当将证明股东资格的证据区分为三个不同的层次：源泉证据、效力证据与对抗证据。依《民事诉讼法》第63条第1款，证据包括八类：当事人的陈述；书证；物证；视听资料；电子数据；证人证言；鉴定意见；勘验笔录。因此，认定股东资格的证据并非仅限于书证，更非简单地局限于出资证明书、股东名册与公司登记机关的登记资料。

　　2、源泉证据是基础性证据

　　股权关系是有因关系，因出资法律行为所创设。源泉证据也称基础证据，就是证明股东取得股权的基础法律关系的法律文件。

　　鉴于股权取得的方式包括原始取得与继受取得，应该将源泉证据分为股东原始取得股权的证据与股东继受取得股权的证据。2014年最高人民法院《公司法解释三》第23条也采取了这种两分法。

　　股东原始取得股权的源泉证据是指能够证明股东依靠自己的出资行为而原始取得股权的证据。既包括创始股东在设立公司时认缴和（或）实缴出资的证据，也包括创始股东之外的新来股东在增资扩股时认缴和（或）实缴出资的证据。源泉证据既包括冠以“出资证明书”的书证，也包括能够证明股东认缴和（或）实缴出资的各类证据，如公司章程、公司设立协议、股东协议、增资扩股协议中有关股东认缴出资的约定，以及股东向公司实缴出资后公司出具的确认其已收到股东股权投资款的收据、股东向公司银行账号汇款后银行出具的汇款回单等各类相关证据。为方便原始股东固定与保全证据，《公司法》第31条重点规定了出资证明书制度。

　　股东继受取得股权的证据系指股东从他人之手继受取得（传来取得）股权的证据。包括股权转让合同、赠予合同、遗嘱、遗赠抚养协议、离婚的判决书或调解书、夫妻财产分割协议、共有财产分割协议、国有股权划拨决定等。为方便继受股东固定与保全证据，《公司法》第31条要求对继受取得股权的新股东签发出资证明书。

　　源泉证据与其他证据之间的关系是源与流、因与果、本与末、根与枝的关系。未载入股东名册，但持有源泉证据的当事人可对公司主张确认自己的股东资格与股东地位。

　　3、推定证据的效力

　　股权的实质是股东与公司之间的法律关系。股权具有请求权、相对权的色彩。因此，法律有理由推定公司知道自己的股东是谁。正是基于这一法律逻辑，最高人民法院《公司法解释三》第22条明确规定：“当事人向人民法院起诉请求确认其股东资格的，应当以公司为被告，与案件争议股权有利害关系的人作为第三人参加诉讼。”

　　值得注意的是，股东资格获得公司确认的意思表示并不仅表现为股东名册，还广泛地表现在公司向股东发送的参加股东会会议的通知、通知股东受领公司分配的股利的通知等。即使某公司没有置备股东名册，倘若公司向某人多次分配股利、多次发送年度财务会计报告、多次通知参加股东会会议，也应解释为公司确认其为股东的意思表示。

　　公司备置股东名册，并应股东之请求变更股东名册是公司对股东所负的法定协助义务。股东有权请求公司履行此种法定协助义务。有些公司的法定代表人炮制所谓的“股东能力测试”，肆意刁难新股东，于法无据，实属闹剧。

　　最高人民法院《公司法解释三》第23条规定：“当事人依法履行出资义务或者依法继受取得股权后，公司未根据公司法第31条、第32条的规定签发出资证明书、记载于股东名册并办理公司登记机关登记，当事人请求公司履行上述义务的，人民法院应予支持。”有限责任公司与股份公司都有义务备置股东名册。

　　在实践中，有些公司根本就没有置备股东名册，即使置备也不规范。此时，任何股东均有权请求公司根据源泉证据、备置或变更股东名册。公司没有置备股东名册，并不妨碍股东资格的确认以及股权之行使。公司无理拒绝的，股东有权以诉讼为之。

　　4、对抗证据具有公示透明性

　　对抗证据（公示信息）主要指在公司登记机关登记在案的章程等登记文件。《公司法》第32条第3款规定：“公司应当将股东的姓名或名称及其出资额向公司登记机关登记；登记事项发生变更的，应当办理变更登记。未经登记或变更登记的，不得对抗第三人。”

　　实践中，倘若股权受让方被载入股东名册，但公司登记机关的股权变更登记手续没有办理，则当事人有权请求公司前往公司登记机关协助办理股权变更登记手续。公司不予申请登记的，出资人或受让人可向法院提起诉讼，请求公司履行申请变更登记义务。

　　与源泉证据及推定证据相比，推定证据具有较高的透明度，具有独特的公示公信效力。首先，善意第三人有权信赖公司登记机关的登记资料（信赖效力）。其次，公司登记机关的登记资料可以对抗非善意第三人（对抗效力）。其三，公司登记机关的登记资料可以方便公众自由查询。

　　根据法律规定，有限责任公司股东变更时，公司有义务办理股东变更登记手续；股份公司的股东变动时，公司无须办理股东变更登记手续。因而，股份公司的股东资格很难求证于公司登记机关。

　　至于上市公司的股权登记，中国**登记结算公司作为法定登记结算机构，搜集和开放查询的股权登记信息具有公示公信效力，尤其是保护第三人善意信赖并对抗非善意第三人的法律效力。

　　5、各种证据相互冲突时的取舍

　　以上三类证据相互冲突时，应区分内部法律关系与外部法律关系。

　　在股东与股东、股东与公司之间的股权确认纠纷中，应尽量尊重源泉证据的效力。而在涉及善意第三人的外部关系中，则应尽量尊重对抗证据的效力。

　　为预防证据冲突带来的法律风险，原始取得和继受取得股权的当事人应当在获得源泉证据以后，尽快请求公司将自己的姓名或名称载入公司的股东名册，并请求公司及时前往公司登记机关办理股东变更登记，实现源泉证据、推定证据与对抗证据的三位一体。

　　6、公司隐名股东受到法律保护

　　在多数情况下，投资者是显名股东。但在现实生活中，常有投资者实际缴纳全部出资，但将第三人尤其是亲朋好友、秘书、司机等注册登记为公司股东。

　　股权代持就是指隐名股东与名义股东相互分离的法律现象与法律关系。隐名股东虽然实际上履行投资义务并享受股东权利，但并未注册登记为公司股东，致使公司的外部人和社会公众，包括债权人、交易伙伴都无法或者很难获知名义股东与隐名股东之间的股权代持关系。

　　股权代持现象存在的社会与法律根源五花八门。既然《公司法》未禁止一方当事人为另一方利益而代持股权，就不能因为《公司法》没有出现“隐名股东”的概念，就仓促得出结论，认为隐名股东不具有法律地位。

　　最高人民法院《公司法解释三》第24条再次就实际股东、隐名股东的确认与保护确立了具有可诉性与可裁性的裁判规则，该条款要求实际股东与名义股东之间存在股权代持合意。

　　该条第2款规定：“实际出资人以其实际履行了出资义务为由向名义股东主张权利的，人民法院应予支持。名义股东以公司股东名册记载、公司登记机关登记为由否认实际出资人权利的，人民法院不予支持。”

　　只要隐名股东能够提供一系列证明其在目标公司有实际缴纳出资、与名义股东之间存在股权代持合意，就应确认股权代持关系以及实际股东、隐名股东的地位。倘若隐名股东还能提供证据证明其在目标公司实际行使了股东权利包括经营管理权乃至控制权的有效证据（包括当事人的陈述、书证、视听资料、电子数据、证人证言），即使名义股东否认股权代持关系，人民法院和仲裁机构也应明察秋毫，依法确认股权代持关系和实际股东、隐名股东的法律地位。倘若实际股东能够举证证明目标公司早已直接确认自己的实际股东地位，则人民法院或者仲裁机构更应旗帜鲜明地保护实际股东的合法权益。

　　三、股权确认之诉的分类有哪些

　　（一）根据诉讼意图进行的分类

　　1、善意之诉

　　这种情况是指原告按照取得股权的意思表示主张股权，而被告则列出种种理由反对。对于此类诉讼，应当保护善意第三人的原则。

　　2、恶意之诉

　　是指原告通过诉讼要求法院确认自己或其他人的股东身份，以获取非法利益或者逃避债务。

　　（二）根据法律关系进行分类

　　1、内部关系的股权确认之诉

　　内部关系包括：挂名股东与实际股东之间；隐名股东与其他股东之间；在内部关系中确认股权，应当坚持民法上的真实意思主义，探究当事人之间的真实意思，并依据该意思对股权进行判断。

　　2、外部关系的股权确认之诉

　　外部关系包括：第一，因公司的债务引起的公司债权人与股东之间的关系。第二，因增资扩股引起的新股东与公司之间的关系。相对于公司与旧股东或者与发起人之间的内部关系，新股东是第三人。在外部法律关系中确认股权，应当坚持商法的表示主义，根据工商登记等对外材料确认股权。

　　（三）根据原告的类型进行分类

　　1、股东提出的确认之诉

　　股东提出确权之诉时，适格的被告应当是公司。理由：第一，股权使股东和公司之间法律关系的一个内容，股权指向的义务主体使公司。原告之所以提出诉讼要求确权，就是因为在主张股权使得不到公司的认可。第二，公司不认可原告股权的意思比较复杂。由于公司使法律拟制的人，公司的所有意思都是通过特定主体来完成的，这些特定主体可以使公司的法定代表人，可以使股东会决议，可以使控股股东，可以使董事经理等公司高管。公司不承认原告股权的意思可以来自于以上任何一个主体，但不论是哪一种情况，最终都是以公司的名义表示出来的。

　　由于公司是法律拟制的人，公司的意思听命于其他主体，与股东相对的真正的矛盾另一方是大股东，法定代表人，此时可以根据需要追加他们为第三人，使判决的效力直接对其产生约束力。

　　在实践中，导致原告提出股权确认之诉的原因有下面几个：

　　第一，原告是隐名股东，其在主张和行使股权时遭到拒绝。

　　第二，原告时挂名，冒名活借名股东，公司产生巨大利润时，要求享受公司利润而遭到公司拒绝。

　　第三，投资与集资的争议。有些情况下投资与集资在表面上区分不开，公司认为是集资和借款，而股东认为是投资，双方发生矛盾，形成诉讼。实践中，许多公司或企业因资金困难，于是便私下招人集资入股，但这些所谓股东的名称却没有进入工商登记档案。当公司或企业效益好转时，企业不想让这些集资的人或出资人参与分红，而这些自认为股东的出资人便要求其股东身份。在此种情况下，二者之间按借贷法律关系处理。当然也有的公司实际上是增资扩股，但故意不完善相关手续，在公司产生巨大利润时，公司借故不向投资人分配利润。

　　第四，原告没有出资，出资不实，他人垫资等情况导致公司不承认其股东身份

　　第五，法律手续不健全，操作不规范，导致公司不认帐。

　　第六，投资与集资的争议。有些情况下投资与集资在表面上区分不开，公司认为是集资和借款，而股东认为是投资，双方发生矛盾，形成诉讼。实践中，许多公司或企业因资金困难，于是便私下招人集资入股，但这些所谓股东的名称却没有进入工商登记档案。当公司或企业效益好转时，企业不想让这些集资的人或出资人参与分红，而这些自认为股东的出资人便要求其股东身份。在此种情况下，二者之间按借贷法律关系处理。当然也有的公司实际上是增资扩股，但故意不完善相关手续，在公司产生巨大利润时，公司借故不向投资人分配利润。

　　2、公司提出的确认之诉

　　公司对股东提出确权之诉通常都是在其他诉讼中附带的提出，作为其他诉讼的前提。

　　以上就是法律快车小编为大家介绍的公司股权确认纠纷如何处理相关内容，从上文我们可以了解到股权确认纠纷中先要确认股东资格，股权确认纠纷中涉及诉讼主体是不一样的，大家可以根据上文进行参考。如果大家还有什么不懂的法律问题，可以咨询法律快车上面的专业律师。